Năm 1957, Chính phủ thành lập Khu Hành chính Lao - Hà - Yên gồm tỉnh Yên Bái, Lao Cai và Hà Giang. Bộ Y tế có chủ trương giao công tác đào tạo cán bộ y tế xã cho các khu y tế và cơ sở đào tạo cán bộ y tế khu Lao - Hà - Yên được thành lập tại địa điểm của Sở Y tế tỉnh Yên Bái hiện nay. Lãnh đạo khu cử bác sĩ Trịnh Đình Lan làm Hiệu trưởng, học viên được đào tạo 9 tháng để trở thành y tá, hộ sinh.

Năm 1959, Chính phủ sáp nhập tỉnh Hà Giang vào Khu tự trị Việt Bắc đồng thời đặt tỉnh Yên Bái, Lao Cai dưới sự lãnh đạo trực tiếp của Chính phủ. Trường đào tạo cán bộ y tế của khu cũng giải thể, cơ sở vật chất của nhà trường chuyển giao cho Ty Y tế Yên Bái.

Năm 1960, Bộ Y tế ra quyết định thành lập Trường cán bộ y tế sơ cấp, Hiệu trưởng là ông Lý Văn Bình - Trưởng Ty Y tế Yên Bái kiêm nhiệm, giáo viên đa phần là bác sỹ, y sỹ, y tá của Ty Y tế và bệnh viện tỉnh kiêm nhiệm. Cơ sở vật chất nhà trường lúc ấy chỉ là nhà tranh, tre, nứa, lá. Học viên được đào tạo thành y tá, nữ hộ sinh.

Cuối năm 1960, ông Lý Văn Bình được điều động về làm Trưởng Ty Y tế Phú Thọ, bác sỹ Nguyễn Bá Phiên là Phó Ty Y tế Yên Bái được bổ nhiệm kiêm chức Hiệu trưởng nhà trường. Giai đoạn 1960 - 1965, nhà trường đào tạo các lớp y tá, nữ hộ sinh, bổ túc văn hóa để đào tạo cán bộ trung cấp tại Trường cán bộ y tế Phú Thọ. Từ năm 1965, đế quốc Mỹ mở rộng chiến tranh, ném bom bắn phá miền Bắc.

Năm 1965, nhà trường có 2 lớp học viên là lớp y sỹ khóa 5 và lớp y tá chính quy khóa 1. Ngày 9/7/1965, máy bay Mỹ ném bom đánh phá thị xã Yên Bái và đã ném bom trúng trường, vùi lấp toàn bộ các hầm trú ẩn của cán bộ, giáo viên, học viên. Trận ném bom này đã làm 54 cán bộ, giáo viên, học sinh nhà trường và của Ty Y tế Yên Bái hy sinh. Sau đó, ngành y tế Yên Bái đã tiến hành sơ tán, chuyển toàn bộ nhà trường, bệnh viện đến xã Đông Lý, huyện Yên Bình.

Giai đoạn này, nhu cầu về cán bộ y tế rất lớn, Bộ Y tế chủ trương mỗi tỉnh đều có trường trung cấp y tế. Ngày 1/4/1966, Ủy ban Hành chính tỉnh Yên Bái ra Quyết định số 316/TCCB-QĐ thành lập Trường Y sỹ trung cấp tỉnh Yên Bái, địa điểm đặt tại nơi sơ tán ở xóm Duộc, xã Đông Lý (nay là xã Đại Đồng), huyện Yên Bình, Hiệu trưởng nhà trường là bác sỹ Nguyễn Bá Phiên.

Đây là một mốc son quan trọng trong lịch sử xây dựng và phát triển của nhà trường. Những năm đầu thành lập, nhà trường vừa đào tạo chuyên môn y tế vừa giảng dạy văn hóa cho những học viên chưa đủ điều kiện về trình độ văn hóa để học chuyên môn.

Cuối năm 1968, do quy hoạch xã Đông Lý - vị trí sơ tán của trường để xây dựng thủy điện Thác Bà nên nhà trường chuyển đến xã Thịnh Hưng (Km 15), huyện Yên Bình. Thầy và trò lại bắt tay xây dựng cơ sở gần với địa điểm sơ tán của bệnh viện tỉnh để thuận lợi cho quá trình giảng dạy và học tập.

Từ năm 1969, bác sỹ Ngô Đức Vượng - Phó Ty Y tế Yên Bái kiêm Hiệu trưởng nhà trường. Lúc này, nhà trường được phép chiêu sinh đào tạo y sỹ chính quy hệ quốc lập, đào tạo 3 năm để cung cấp cán bộ cho các bệnh viện tuyến tỉnh và tuyến huyện đồng thời đào tạo các lớp y sỹ dân lập, y tá, dược tá để phục vụ tuyến xã.

Năm 1972, đế quốc Mỹ ném bom trở lại miền Bắc, nhà trường sơ tán ở 4 điểm: bộ phận lãnh đạo ở lại xã Thịnh Hưng để chỉ đạo chung, một bộ phận ở xã Phú Thịnh (Yên Bình), một bộ phận đến xã Mông Sơn (Yên Bình), một bộ phận đến xã Liễu Đô (Lục Yên).

Mặc dù gặp rất nhiều khó khăn nhưng với quyết tâm thi đua thực hiện lời dạy của Bác, các lớp học sinh ra trường thời đó, đã có nhiều người lên đường nhập ngũ; nhiều người tham gia phục vụ sự nghiệp chăm sóc và bảo vệ sức khỏe nhân dân. Trong giai đoạn này, nhà trường đã đào tạo được 1.135 học viên, gồm  410 y sỹ đa khoa, 600 y tá sơ học và 125 dược tá.

Ngày 27/3/1975, tại kỳ họp thứ 2, Quốc hội khóa V đã nghị quyết hợp nhất ba tỉnh Lào Cai, Yên Bái, Nghĩa Lộ thành tỉnh Hoàng Liên Sơn. Tháng 9/1976 ba trường y sỹ của ba tỉnh cũng hợp nhất thành Trường Trung học Y tế Hoàng Liên Sơn, trụ sở đặt tại Trường Y sỹ Yên Bái, bác sỹ Nguyễn Long - Hiệu trưởng Trường Y sỹ  Nghĩa Lộ được bổ nhiệm làm Hiệu trưởng Trường Trung học Y tế Hoàng Liên Sơn.

Đến năm 1987, tỉnh quyết định bổ nhiệm bác sỹ Nguyễn Trọng Cương làm Hiệu trưởng nhà trường. Cơ sở vật chất của nhà trường giai đoạn này được chia làm 3 khu: khu A - địa điểm Sở Y tế Yên Bái hiện nay - là khu ở của giáo viên, giảng đường, nhà ăn tập thể; khu B - địa điểm nhà trường hiện nay - là khu ký túc xá, cơ sở thực hành; khu C do chính quyền xã Minh Bảo cho mượn để thầy, trò nhà trường đào ao thả cá, trồng lúa, trồng sắn...

Giai đoạn này, nhà trường tiếp tục đào tạo các khóa trung học và sơ học bao gồm hệ biên chế Nhà nước, hệ dân lập là y sỹ, y tá, dược tá, nữ hộ sinh sơ học; phối hợp với các trung tâm y tế đào tạo y tá cụm dân cư tại các huyện vùng cao.

Từ năm học 1978 - 1979, nhà trường tổ chức đào tạo hai ngành học mới là y tá trung học và nữ hộ sinh trung học. Trong 15 năm hợp nhất, Trường Trung học Y tế Hoàng Liên Sơn đã đào tạo 1.580 y sỹ, 220 nữ hộ sinh trung học, 310 y tá trung học, 890 y tá sơ học, 370 hộ sinh sơ học, 44 dược tá.

Ngày 12/8/1991, tại kỳ họp thứ 9, Quốc hội khóa VIII ra Nghị quyết chia tách tỉnh Hoàng Liên Sơn thành tỉnh Yên Bái và Lào Cai. Trường Trung học Y tế Yên Bái được tái lập với biên chế 46 cán bộ, giáo viên, quy mô 300 học sinh. Năm 1993, bác sỹ Trần Thị Tình được bổ nhiệm làm Hiệu trưởng nhà trường. Tháng 9.1998, bác sỹ Trần Thị Tình nghỉ hưu, tỉnh bổ nhiệm bác sỹ Bùi Ngọc Trác làm Hiệu trưởng. Tháng 7.2008, bác sỹ Bùi Ngọc Trác nghỉ hưu, tỉnh bổ nhiệm thạc sỹ, bác sỹ Lương Bá Phú làm Hiệu trưởng cho đến nay.

Trong giai đoạn này, nhà trường hướng công tác đào tạo cung cấp nguồn nhân lực cho y tế cơ sở, xóa xã trắng về y tế đồng thời tiếp tục đào tạo cán bộ y tế cho tỉnh Lào Cai. Từ năm học 2007 - 2008, nhà trường đã đào tạo cho nước bạn Lào hai khóa điều dưỡng trung học và y sỹ. Tính đến nay, đã có 49 lưu học sinh Lào tốt nghiệp về nước, tham gia phục vụ sự nghiệp chăm sóc và bảo vệ sức khỏe nhân dân các bộ tộc Lào.

Trước yêu cầu của sự nghiệp chăm sóc và bảo vệ sức khỏe nhân dân trong giai đoạn mới và chủ trương của cấp trên, ngày 28/3/2008, Ủy ban nhân dân tỉnh Yên Bái đã có Công văn số 460/UBND-VX chỉ đạo các sở, ban, ngành của tỉnh và nhà trường xây dựng Đề án thành lập Trường Cao đẳng Y tế Yên Bái trên cơ sở Trường Trung cấp Y tế Yên Bái. Sau một thời gian tích cực chuẩn bị để đáp ứng các điều kiện cần thiết, ngày 28.7.2011, Bộ Giáo dục và Đào tạo đã ra Quyết định số 3079/QĐ-BGDĐT thành lập Trường Cao đẳng Y tế Yên Bái trên cơ sở Trường Trung cấp Y tế Yên Bái.

Hội thi học sinh giỏi Trường Cao đẳng Y tế Yên Bái năm 2011.

45 năm qua, Trường Cao đẳng Y tế Yên Bái đã đào tạo 9.508 học sinh ra trường bao gồm y sỹ, y tá/điều dưỡng trung cấp, hộ sinh trung cấp, dược sỹ, y tế thôn bản, y tế - dân số thôn bản, dược tá, hộ sinh sơ học. Nhà trường đã được tặng thưởng nhiều bằng khen, cờ thi đua của tỉnh và của bộ, ngành Trung ương đối với tập thể và cá nhân.

Đặc biệt, nhà trường đã được Nhà nước tặng thưởng Huân chương Lao động hạng Ba năm 2001, Huân chương Lao động hạng Nhì năm 2006; Bộ Y tế tặng Cờ đơn vị xuất sắc trong phong trào thi đua năm 2009; Chủ tịch nước phong tặng danh hiệu 1 nhà giáo ưu tú, 3 thầy thuốc ưu tú.

Trường Cao đẳng Y tế Yên Bái được thành lập - đây là niềm vinh dự, tự hào, niềm vui lớn, đánh dấu sự phát triển, trưởng thành của nhà trường. Nhà trường tiếp tục triển khai và thực hiện tốt các nhiệm vụ: từng bước hoàn chỉnh mô hình tổ chức của một trường đào tạo đa ngành, ba cấp (trường, khoa, bộ môn); quy hoạch, sắp xếp đội ngũ cán bộ quản lý, cán bộ giảng dạy và cán bộ phục vụ đủ về số lượng theo quy mô đào tạo, mạnh về chất lượng, đáp ứng yêu cầu đào tạo cán bộ y - dược cho tỉnh và khu vực. Mặt khác, hoàn thiện việc xây dựng, thẩm định và mở các mã ngành đào tạo mới ở trình độ cao đẳng là cao đẳng điều dưỡng, cao đẳng hộ sinh; hoàn thiện Dự án đầu tư xây dựng công trình Trường Cao đẳng Y tế Yên Bái do Ủy ban nhân dân tỉnh đã phê duyệt tại xã Phúc Lộc, thành phố Yên Bái giai đoạn 2011 - 2015.

Thầy thuốc ưu tú, thạc sĩ, bác sĩ  Lương Bá Phú - Hiệu trưởng Trường Cao đẳng Y tế Yên Bái