Tại phiên bế mạc, Quốc hội thảo luận tại hội trường về Dự thảo Luật Bảo vệ và Kiểm dịch thực vật. Dự thảo luật này gồm có 5 chương, 77 điều, trong đó ngoài những quy định chung, có quy định về phòng chống sinh vật gây hại thực vật, kiểm dịch thực vật, thuốc bảo vệ thực vật. Thảo luận về dự thảo luật này, đa số ý kiến đại biểu Quốc hội đồng tình nâng Pháp lệnh Bảo vệ và Kiểm dịch thực vật lên thành Luật để điều chỉnh thực trạng sử dụng thuốc bảo vệ thực vật rất nguy hại hiện nay. Luật đã quy định về phòng chống sinh vật gây hại, luật cần kiên quyết cấm việc đưa sinh vật gây hại vào Việt Nam.

Công tác quản lý việc sử dụng thuốc rất khó khăn, trong khi ý thức trách nhiệm của người sử dụng đối với sức khỏe cộng đồng rất kém. Vì vậy có đại biểu đề xuất phải thực hiện nghiêm việc chủ sở hữu phải chịu trách nhiệm kinh phí tiêu hủy thuốc bảo vệ thực vật bị tiêu hủy. Cần có chế tài xử phạt các hành vi vi phạm pháp luật liên quan đến lĩnh vực này, đồng thời  đề nghị phải siết chặt trong quảng cáo thuốc bảo vệ thực vật.

Cũng trong phiên bế mạc, Quốc hội đã thông qua Nghị quyết về việc kéo dài thời hạn đất trồng cây hàng năm, đất nuôi trồng thuỷ sản, đất làm muối của hộ gia đình, cá nhân, với tỷ lệ 95,18% số đại biểu tán thành. Đồng thời, thông qua Nghị quyết về kết quả giám sát “Việc thi hành Luật Thực hành tiết kiệm, chống lãng phí trong sử dụng nguồn vốn trái phiếu Chính phủ cho đầu tư xây dựng cơ bản, giai đoạn 2006-2012” và thông qua Nghị quyết về chất vấn và trả lời chất vấn tại kỳ họp thứ 5, Quốc hội khóa XIII, với tỷ lệ 94,78% số đại biểu tán thành thông qua.

Phát biểu bế mạc kỳ họp, Chủ tịch Quốc hội Nguyễn Sinh Hùng nhấn mạnh: Quốc hội yêu cầu Chính phủ, các cấp, các ngành, các địa phương, trong những tháng cuối năm, tập trung triển khai thực hiện có kết quả đề án tái cơ cấu tổng thể nền kinh tế, tạo cho được chuyển biến tích cực về mọi mặt, từng bước tháo gỡ khó khăn, thúc đẩy sản xuất kinh doanh phát triển, bảo đảm ổn định kinh tế vĩ mô, nợ xấu, hàng tồn kho giảm. Tạo thêm nhiều việc làm, bảo đảm an sinh xã hội, quốc phòng, an ninh, trật tự an toàn xã hội. Phấn đấu hoàn thành tốt nhất các mục tiêu, chỉ tiêu chủ yếu của kế hoạch phát triển KT - XH năm 2013, mở ra triển vọng  tốt nhất thực hiện kế hoạch phát triển KT – XH, 5 năm giai đoạn (2011 – 2016). Về nội dung của dự thảo sửa đổi Hiến pháp 1992, Quốc hội yêu cầu Ủy ban dự thảo sửa đổi hiến pháp, các cơ quan, tổ chức có trách nhiệm nghiên cứu, tiếp thu nghiêm túc các ý kiến của đại biểu Quốc hội, tiếp tục tiếp nhận ý kiến góp ý của nhân dân, đến ngày 30/9/2013, để hoàn thiện dự thảo sửa đổi Hiến pháp, trình Quốc hội xem xét, thông qua tại kỳ họp thứ 6. Với quyết tâm của toàn Đảng, toàn dân nhất định chúng ta sẽ xây dựng được một ban Hiếp pháp thể hiện ý chí, nguyện vọng của nhân dân, đáp ứng yêu cầu xây dựng bảo vệ và phát triển đất nước trong thời gian tới.

Quốc hội đã xem xét thông qua 9 Luật, Nghị quyết xây dựng, điều chỉnh Pháp lệnh Quốc hội năm 2013 và chương trình xây dựng, điều chỉnh Pháp lệnh năm 2014. Cho ý kiến về 8 dự án luật và ban hành những nghị quyết quan trọng khác. Đây là các dự án luật và các nghị quyết quan trọng sẽ góp phần thúc đẩy phát triển KT – XH, khoa học công nghệ, củng cố quốc phòng an ninh và phát triển bền vững của đất nước. Quốc hội yêu cầu Chính phủ, các bộ, ngành, tổ chức hữu quan có kế hoạch nghiên cứu, tổng kết thực tiễn một cách nghiêm túc khi đề xuất, ban hành luật, pháp lệnh và sớm triển khai ban hành các văn bản thi hành luật, pháp lệnh đã được thông qua. Đẩy mạnh công tác tuyên truyền, phổ biến giáo dục để pháp luật sớm đi vào cuộc sống. Hội đồng dân tộc, các Ủy ban Quốc hội, các đại biểu Quốc hội tập trung làm tốt công tác giám sát, thi hành pháp luật theo luật định.

Tại kỳ họp này, lần đầu tiên trong lịch sử, hoạt động Quốc hội chức lấy phiếu tín nhiệm đối với các chức vụ do Quốc hội bầu và phê chuẩn. Việc lấy phiếu tín nhiệm được triển khai thận trọng, nghiên túc, theo đúng quy trình thủ tục hướng dẫn của Quốc hội. Toàn bộ quy trình lấy phiếu tín nhiệm đảm bảo dân chủ, công khai, minh bạch để công luận và đồng bào cử tri cả nước theo dõi, giám sát. Kết quả lấy phiếu tín nhiệm đã phản ánh trung thực tình hình KT – XH, quốc phòng an ninh, hoạt động đối ngoại và các hoạt động tư pháp của đất nước. Đây cũng là kinh nghiệm tốt để các cơ quan, tổ chức có trách nhiệm ở Trung ương, địa phương và hội đồng nhân dân các cấp cân nhắc, vận dụng khi tổ chức lấy phiếu tín nhiệm trong thời gian tới và triển khai tổ chức lấy phiếu tín nhiệm HĐND các cấp ở các địa phương ngay sau kỳ họp này, đáp ứng lòng mong mỏi của nhân dân.

Đức Toàn