Vào 04h00 ngày 16/9, lũ trên các sông ở Thanh Hóa, Nghệ An và hạ lưu sông Ngàn Sâu, sông La (Hà Tĩnh) đang lên; thượng lưu sông Ngàn Sâu, sông Ngàn Phố (Hà Tĩnh) và các sông ở Quảng Bình, Quảng Trị đang xuống. Mực nước trên các sông ở thời điểm này như sau:

- Sông Ngàn Sâu tại Chu Lễ: 12,64m, trên báo động (BĐ)2 là 0,64m; tại Hòa Duyệt: 6,9m, dưới mức BĐ1 0,6m;

- Sông La tại Linh Cảm: 2,56m, dưới BĐ1;

- Sông Gianh tại Đồng Tâm lúc 1h/16/9: 12,31m (trên BĐ2 là 0,31m); tại Mai Hóa lúc 1h/16/9: 5,77m, trên BĐ2 là 0,77m;

- Sông Kiến Giang tại Lệ Thủy lúc 1h/16/9: 1,51m, trên BĐ1 0,31m;

- Sông Thạch Hãn tại Thạch Hãn lúc 1h/16/9: 2,59m, ở mức BĐ1.

Trong 12 giờ tới, mực nước trên các sông ở Thanh Hóa, Nghệ An và hạ lưu sông Ngàn Sâu, sông La tiếp tục lên, thượng lưu các sông Ngàn Sâu, Ngàn Phố và các sông ở Quảng Bình, Quảng Trị tiếp tục xuống, mực nước trên các sông có khả năng như sau:

- Sông Ngàn Sâu tại Chu Lễ xuống mức 12,0m (mức BĐ2); tại Hòa Duyệt lên mức 7,2m, dưới BĐ1: 0,3m;

- Sông La tại Linh Cảm: 3,5m, dưới BĐ1 1,0m;

- Các sông ở Thanh Hóa, Nghệ An còn dưới mức BĐ1;

- Các sông ở Quảng Bình, Quảng Trị xuống dưới mức BĐ1.

Nguy cơ cao sẽ xảy ra lũ quét, sạt lở đất ở vùng núi, ngập úng vùng trũng thấp ở tỉnh Hòa Bình, Sơn La, Yên Bái, Tuyên Quang và các tỉnh từ Thanh Hóa đến Hà Tĩnh. Đặc biệt là các huyện: Mai Châu, Đà Bắc, Kỳ Sơn, Lương Sơn, Kim Bôi, Lạc Thủy (Hòa Bình); Sốp Cộp, Sông Mã, Yên Châu, Mộc Châu, Phù Yên (Sơn La); Văn Yên, Trạm Tấu, Văn Chấn, Trấn Yên (Yên Bái); Hàm Yên, Chiêm Hóa, Sơn Dương (Tuyên Quang); Mường Lát, Thạch Thành, Quan Hóa, Bá Thước, Cẩm Thủy (Thanh Hóa); Kỳ Sơn, Con Cuông, Tương Dương, Quỳ Châu, Quế Phong, Quỳ Hợp (Nghệ An); Hương Sơn, Vụ Quang, Hương Khê, Đức Thọ (Hà Tĩnh).